工程预算审核以单位工种为标的，只对单位工程造价的合理负责。审计与工程造价审核是两个截然不同的专业学科，审计以会计师、审计师为主；而工程造价审核以工程经济和工程技术人员为主。目前 正在实程量清单计价的突出特点就是“量价分离、投标竟争”。工程量的产生依据施工图、设计变更、施工过程中产生的洽商来确定，费用产生的依据是由施工企业依据自身的施工管理水平确定的直接费、间接费、措施费、利润四部分的总和。
如某年我们对某单位小区室外管网工程决算进行审计，经过筛选有一签证工程量为996m的供水管子决算书中所报工程量却大了10倍，工程预算核减10.8万元；另有一子目总金额11.3万元，经反复比对发现是送审单位预算员篡改子目单价造成的，核减3.8万元。利用工程定额规定的工作内容进行审查，验证工程决算工程量与定额中规定的工作内容是否一致来确定工程造价的真实性、合理性的一种审计技术方法。如某年我们对某单位一基建项目进行审计，从决算书中查出屋面防水工程子目中SBS防水以包含冷底子油的工作内容及其造价，施工单位报送的决算书中又单独计算冷底子油子目明显多计工程。
单位工程预算的编制依据
(1)上级领导对该单位工程的要求、建设单位的意图和要求、工程承包合同、施工图对施工的要求等；
(2)施工组织总设计和施工图；
(3)年度施工计划对该工程的安排和规定的各项指标；
(4)预算文件提供的有关数据；
(5)劳动力配备情况，材料、构件、加工品的来源和供应情况，主要施工机械的生产能力和配备情况
工程预算主要是根据 有关法规和政策，依据 建设行政主管部门颁发的工程定额工料消耗标准、取费标准以及人工、材料、机械台班价格参数、设计图纸和工程实物量，工程造价的确认和控制进行有效的监督检查。在工程项目实施阶段，以承包合同为基础，在竣工验收后结合施工变更、工程签证的情况，作出符合施工实际的竣工造价审查结果，它是承发包双方结算的依据，也是工程决算的基础资料和依据。