工程预算由于间接费、利润、税金等各项费用，是按照工程的专业（土建、安装、装饰、市政、人防、园林等）和工程类别（即按照施工难易程度分一、二、三、四类）分别规定了取费标准，审查时应该注意以下几个问题：审查取费标准是否与所用定额相匹配。在编制决算时，主体工程选用某专业定额，则取费标准必须选用与该专业配套使用的标准审查取费标准是否与工程类别相吻合。首先，根据工程规模及工程类别划分标准表，确定工程类别；然后，审查是否按确定的工程类别计取费用。如土建工程与安装工程的工程类别应分别按各自的工程类别划分标准表确定。
施工单位施工过程中对技术资料的未能完整归档或有意不建档，造成建设单位在工程竣工后无法建立完整的工程资料档案并按要求报送工程结算所需资料，从而使审计工作周期拉长、风险加大。这个问题也的确存在。不过，按照一般的情况，审计周期是按提供完整的资料开始计算的。除非你自己的要求没有到位，那也怨不得别人。什么叫风险加大？是你审计费用不够用了吧？既然做了审计这个行业，就要有这个思想准备，否则人家建设单位为什么出钱给你啊！建设单位缺乏工程技术专管人员和工程技术专业知识或工程技术人员职业道德水准不高，造成工程项目施工中不合规的变更签证增多，从而使得工程预算随意增大。
为公路新疆工程预算估算的准确性，应用模糊神经网络法对公路新疆工程预算进行估算。结合工程案例，详细探讨了公路新疆工程预算估算中模糊神经网络的应用，结果表明，采用模糊神经网络方法能够有效降低公路新疆工程预算估算结果的平均误差，可以极大程度提高新疆工程预算计算精度，获得合理的造价。神经网络对于公路工程建设企业来说，工程估价的准确性与合理性，直接决定着项目投资决策的正确性，是分析工程项目可行性的主要环节，同时也是公路工程项目标底编制的主要控制标准，因此新疆工程预算估算的准确性，是各建设单位研究的重点内容，其对加强公路工程项目成本管理，有着积极的作用。公路工程管理工作中，造价管理是主要内容，此项工作直接影响着建设企业的效益与工程的质量，历来都是管理的核心部分。新疆工程预算估算是项目前期管理的重要内容，是实现项目成本控制目标的基础。造价估算能够为项目施工方提供成本控制方案编制的依据。在设计新疆工程预算前，明确工程预计造价，能够避免新疆工程预算环节恶意行为的发生。模糊神经网络应用流程。近年来，公路新疆工程预算估算工作中，多采取模糊神经网络来进行估算。公路新疆工程预算估算，多是通过输入公路工程相关要求与特点， 输出估算结果，这与模糊神经网络应用原理极为相似，模糊神经网络的应用优势。公路新疆工程预算估算中，采取模糊神经网络法，具有以下优点造价模型化利用模糊数学，可以处理模糊信息。采取对比已建设和新建的公路工程，进行定量化描述，使得相关问题可以模型化。结果更为科学开展公路新疆工程预算估算，应用模糊神经网络，再通过构建数学模型，进行数学计算分析，能够减少人为计算的误差，计算结果的准确性与科学性较高。
工程预算审计主要针对工程项目决算的，在一个建设项目竣工完成，建设单位与施工单位结算工程款时进行的。工程预算审计就是工程预算审核（审价），是工程预算咨询单位咨询业务的一部分。受业主委托对其工程项目的概算、预算及结算等，依据现行 政策法规、计价依据及相关工程技术资料对送审造价的工程量、单价及取费等进行逐项审核。在运用工程量清单计价模式进行工程预算审计工作时，可以从以下几个方面来进行：