工程预算审计组长的职责（1）确定跟踪审计小组人员的分工和岗位职责。（2）主持编写项目跟踪审计实施方案，负责跟踪审计项目的内部管理和外部协调工作。审阅重要的咨询成果文件，制定咨询原则，处理重要技术问题。（3）负责跟踪审计项目内各层次、各专业人员之间的技术协调、组织管理、质量管理等工作，处理审核人、校核人、编制人员之间的技术分歧意见，对形成的咨询成果质量负责。（4）根据项目实施方案，动态掌握项目造价变化情况，负责确定阶段控制目标，进行风险预测，分析偏差制定纠偏措施。（5）组织编写咨询成果文件的总说明、总目录，审核成果文件。
工程预算建设单位是否在招标前将该项目的招标用图纸和工程量清单（或调整工程量清单）进行了认真的对比审核。工程量清单是根据招标用图纸，按照招标文件上的各细目计量方法汇总出来的。它既是招投标时各投标单位报价的共同基础，也是合同签定后施工过程中变更、计量的基础。目前工程量清单大多由设计院或工程咨询事物所编制，没有第二家单位复核，准确度较低，如果清单量与实际施工图数量出入太大，会使合同价（或中标价）过高或过低，即使在中标以后另行调整，也会给施工单位按合同文件提请变更单价埋下伏笔。
工程预算承包人按专业条款的约定时间，提交当月(或节点)完成形象进度，监理工程师(或甲方代表)在规定的时间内核实已完工程量。对合同范围内的工程量和变更的工程量分别签证认可。（2）承包人根据工程量检验认可的证明，编制当月(节点)的工程量完成统计报表(按合同要求)及月度(节点)工程价款结算书，提供进度款申请并附上与进度款审批有关的支持材料。报基建部门，由委托的造价咨询单位确认。（3）对月度(节点)工程价款结算书进行审核，首先审核签证记录的真实性、合法性，然后核定确认工程量；审核工程所套定额或清单价是否与工程执行定额或清单子目相符，实物工程量与图纸不符、施工情况与施工合同不符、施工用料发生变化，必须获取必要的签证，对暂定价款、综合单价调整、变更进度款要根据合同中的规定，审核时据实调整。（4）对审核结果由造价咨询单位出具审核意见。（5）根据每月(节点)的实际付款填制工程款使用计划执行情况。
工程预算通过分析各项费用指标来找出工程预算审计的突破口，准确完整的反映工程的实际造价。如对某单位一建筑项目进行审计，审计人员通过审查发现该项目与以往审计过的某幢建筑物A的设计完全想同，经过测算该项目的经济造价指标和部分材料指标均高出A建设工程，审计人员进一步审计发现该项工程多计钢材16.3t；商品砼多计128.8m3。由于上年价格指数变动不大，且使用的是同一估价本，所以审计人员在审计过程中只考虑价差问题未考虑价格上涨指数，审计人员核减工程预算合计15.78万元。