工程预算税费的比较公路工程利润计算方法是直接成本加上间接费用减去规费，费率为7.42％。市政道路工程利润是综合单价的组成内容，属于固定基准价格。公路工程和市政道路工程的税收计算方法是一致的，税费包括增值税、城市维护费及教育费附加，不同之处在于公路工程的税费是综合单价的组成部分，税率为9%，税费计算基数是不含进项税的，而市政道路工程的税费为按专业经过测算的综合税率，税费的计算基数是含进项税的。施工监理费用的计算依据是建安工程费，建设单位管理费用的依据是建安工程费，采用累进制进行计算。
工程预算由于工程建设涉及面广和其本身所具有的复杂性，在其建设过程中，不可避免地发生设计变更、材料设备变更等多种引起工程预算变化的情况。对于采取中标价从签证作为结算方式的工程，更应注意增减费用的审查。应注意设计变更的审查。设计变更单是设计单位在施工中发现需要变更的部位，或是由于建设单位需要改变使用功能、装修标准等而发出的变更通知单。它应是由设计单位、建设单位、施工单位、监理单位协商后共用签署的。审查设计变更时，一要应查验手续是否完备；二要判定该项变更是否引起经济利益上的增减变动，因为有的变更只是技术变更，并不引起经济变更。还要注意查阅竣工图，因为对于工程量增加而引起费用增加的项目。
决策阶段控制工程预算人工及人力车运土、石渣定额，适用于道路坡度≤15%以内，如遇上坡坡度＞15%且≤40%时，其运距按坡段斜长乘以系数1.5；坡度＞40%时，按坡底至坡顶平均标高计算垂直深度每1m折成水平运距10m计算。在同一条线路上坡度不同时，分段计算。遇有下坡时，运距按斜长计算处理渗水或积水发生的费用另行计算。石方微差造价的履盖防护费用已包含在定额项目中，不另行计算。其他石方造价定额项目未包含造价时所需覆盖防护费用，发生时另行计算。
工程预算审计方法还有很多各有各的优缺点 ，要提高审计效率，关键是要会选择。政府投资项目范围广泛 ，各项目的建设难度、标准也不一致。另外，政府工程经常受到人为因素和自然条件的影响，往往建设时间长，存在较多的设计变更和现场签证 ，有的项目在审计时已经发生变化 ，甚至无法进行现场取证。这些因素决定了工程预算审计具有多样性、复杂性和风险性。因此，选择审计方法时，既要考虑不同的审计阶段和审计内容，还要结合审计目标，注意审计方法之间的交叉使用和外部审计条件的许可，做到有的放矢、科学使用。